筆記本散熱底座使用起來十分簡單，首先，將筆記本散熱底座平置，然后連接上供電電源，使散熱底座風扇孔朝上打開前端供電開關，之后將筆記本平放于散熱底座上面即可。無論什么環境下，注意留出所有散熱風扇的出風口，保證空氣可以攜帶熱量快速擴散出去。
另外，還需要特別注意的是散熱底座的噪音和震動問題。風扇的數量和質量是決定因素，風扇多固然增加散熱效果，但是相應的耗電及噪音震動也增加了，所以一般以2~3個為宜。